Protein–RNA interactions for Protein: P28777

ARO2, Chorismate synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARO2P28777 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.9□□□□□ -2.27
ARO2P28777 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
ARO2P28777 IML1YJR138W 4755 nt0.9□□□□□ -2.27
ARO2P28777 PRP42YDR235W 1635 nt0.89□□□□□ -2.27
ARO2P28777 FYV10YIL097W 1551 nt0.88□□□□□ -2.27
ARO2P28777 SCC2YDR180W 4482 nt0.88□□□□□ -2.27
ARO2P28777 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.88□□□□□ -2.27
ARO2P28777 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.88□□□□□ -2.27
ARO2P28777 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.88□□□□□ -2.27
ARO2P28777 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.88□□□□□ -2.27
ARO2P28777 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.88□□□□□ -2.27
ARO2P28777 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.88□□□□□ -2.27
ARO2P28777 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.88□□□□□ -2.27
ARO2P28777 RPL26BYGR034W 384 nt0.88□□□□□ -2.27
ARO2P28777 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.87□□□□□ -2.27
ARO2P28777 COX5BYIL111W 456 nt0.87□□□□□ -2.27
ARO2P28777 KAP120YPL125W 3099 nt0.86□□□□□ -2.27
ARO2P28777 PRP5YBR237W 2550 nt0.86□□□□□ -2.27
ARO2P28777 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.86□□□□□ -2.27
ARO2P28777 YML002WYML002W 2214 nt0.85□□□□□ -2.27
ARO2P28777 BEM2YER155C 6504 nt0.85□□□□□ -2.27
ARO2P28777 YDR544CYDR544C 429 nt0.83□□□□□ -2.28
ARO2P28777 YLR041WYLR041W 321 nt0.83□□□□□ -2.28
ARO2P28777 YPR117WYPR117W 7470 nt0.83□□□□□ -2.28
ARO2P28777 UTP8YGR128C 2142 nt0.82□□□□□ -2.28
ARO2P28777 TAH1YCR060W 336 nt0.82□□□□□ -2.28
ARO2P28777 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.82□□□□□ -2.28
ARO2P28777 YGL182CYGL182C 324 nt0.82□□□□□ -2.28
ARO2P28777 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.82□□□□□ -2.28
ARO2P28777 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.8□□□□□ -2.28
ARO2P28777 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.79□□□□□ -2.28
ARO2P28777 YDL073WYDL073W 2955 nt0.79□□□□□ -2.28
ARO2P28777 CHS6YJL099W 2241 nt0.78□□□□□ -2.28
ARO2P28777 PRP16YKR086W 3216 nt0.77□□□□□ -2.29
ARO2P28777 SIP4YJL089W 2490 nt0.77□□□□□ -2.29
ARO2P28777 SEC8YPR055W 3198 nt0.77□□□□□ -2.29
ARO2P28777 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.77□□□□□ -2.29
ARO2P28777 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.76□□□□□ -2.29
ARO2P28777 ROM2YLR371W 4071 nt0.76□□□□□ -2.29
ARO2P28777 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.76□□□□□ -2.29
ARO2P28777 YOR102WYOR102W 351 nt0.76□□□□□ -2.29
ARO2P28777 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.75□□□□□ -2.29
ARO2P28777 SNU13YEL026W 381 nt0.74□□□□□ -2.29
ARO2P28777 YLR232WYLR232W 348 nt0.74□□□□□ -2.29
ARO2P28777 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.74□□□□□ -2.29
ARO2P28777 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.73□□□□□ -2.29
ARO2P28777 snR39BsnR39B 96 nt0.73□□□□□ -2.29
ARO2P28777 OST4YDL232W 111 nt0.72□□□□□ -2.29
ARO2P28777 STF2YGR008C 255 nt0.72□□□□□ -2.29
ARO2P28777 YOR170WYOR170W 306 nt0.71□□□□□ -2.3
ARO2P28777 snR48snR48 113 nt0.71□□□□□ -2.3
ARO2P28777 LTE1YAL024C 4308 nt0.71□□□□□ -2.3
ARO2P28777 UTP20YBL004W 7482 nt0.68□□□□□ -2.3
ARO2P28777 SEC1YDR164C 2175 nt0.68□□□□□ -2.3
ARO2P28777 QCR9YGR183C 201 nt0.68□□□□□ -2.3
ARO2P28777 COG6YNL041C 2520 nt0.66□□□□□ -2.3
ARO2P28777 SDH6YDR379C-A 240 nt0.66□□□□□ -2.3
ARO2P28777 HUG1YML058W-A 207 nt0.66□□□□□ -2.3
ARO2P28777 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.66□□□□□ -2.3
ARO2P28777 YDR210WYDR210W 228 nt0.65□□□□□ -2.31
ARO2P28777 YGR164WYGR164W 336 nt0.65□□□□□ -2.31
ARO2P28777 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.65□□□□□ -2.31
ARO2P28777 BEM3YPL115C 3387 nt0.65□□□□□ -2.31
ARO2P28777 ATP8Q0080 147 nt0.64□□□□□ -2.31
ARO2P28777 Q0092Q0092 141 nt0.63□□□□□ -2.31
ARO2P28777 YNL170WYNL170W 396 nt0.63□□□□□ -2.31
ARO2P28777 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.63□□□□□ -2.31
ARO2P28777 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
ARO2P28777 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.62□□□□□ -2.31
ARO2P28777 PAU24YBR301W 363 nt0.62□□□□□ -2.31
ARO2P28777 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.61□□□□□ -2.31
ARO2P28777 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.61□□□□□ -2.31
ARO2P28777 NNF2YGR089W 2811 nt0.61□□□□□ -2.31
ARO2P28777 UTP10YJL109C 5310 nt0.6□□□□□ -2.31
ARO2P28777 YSP1YHR155W 3687 nt0.59□□□□□ -2.31
ARO2P28777 PAU12YGR294W 363 nt0.59□□□□□ -2.31
ARO2P28777 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.59□□□□□ -2.31
ARO2P28777 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.58□□□□□ -2.32
ARO2P28777 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.58□□□□□ -2.32
ARO2P28777 FMP27YLR454W 7887 nt0.57□□□□□ -2.32
ARO2P28777 ORC3YLL004W 1851 nt0.57□□□□□ -2.32
ARO2P28777 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.57□□□□□ -2.32
ARO2P28777 BUL2YML111W 2763 nt0.57□□□□□ -2.32
ARO2P28777 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.56□□□□□ -2.32
ARO2P28777 RPS26AYGL189C 360 nt0.56□□□□□ -2.32
ARO2P28777 PET111YMR257C 2403 nt0.54□□□□□ -2.32
ARO2P28777 NIP1YMR309C 2439 nt0.54□□□□□ -2.32
ARO2P28777 YMR160WYMR160W 2451 nt0.53□□□□□ -2.32
ARO2P28777 GLG1YKR058W 1851 nt0.53□□□□□ -2.32
ARO2P28777 CSE1YGL238W 2883 nt0.52□□□□□ -2.33
ARO2P28777 SBH1YER087C-B 249 nt0.5□□□□□ -2.33
ARO2P28777 ULP2YIL031W 3105 nt0.5□□□□□ -2.33
ARO2P28777 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.48□□□□□ -2.33
ARO2P28777 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.48□□□□□ -2.33
ARO2P28777 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.48□□□□□ -2.33
ARO2P28777 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.48□□□□□ -2.33
ARO2P28777 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.48□□□□□ -2.33
ARO2P28777 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.48□□□□□ -2.33
ARO2P28777 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.48□□□□□ -2.33
ARO2P28777 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.48□□□□□ -2.33
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