Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED1O96006 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED1O96006 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms