Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2F3O00716 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F3O00716 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F3O00716 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F3O00716 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F3O00716 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F3O00716 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F3O00716 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F3O00716 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F3O00716 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F3O00716 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F3O00716 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F3O00716 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F3O00716 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F3O00716 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F3O00716 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms