Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQV1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQV1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQV1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQV1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQV1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQV1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQV1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQV1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQV1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BQV1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
H3BQV1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
H3BQV1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BQV1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BQV1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQV1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQV1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQV1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQV1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQV1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQV1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQV1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQV1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQV1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQV1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQV1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQV1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQV1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BQV1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BQV1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQV1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQV1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQV1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQV1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQV1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQV1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQV1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BQV1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms