Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB4A4D0S4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMB4A4D0S4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms