Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRF2-201ENST00000296862 2127 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2B3-203ENST00000372183 1457 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP22-1-201ENST00000334680 296 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM1P14-201ENST00000343743 866 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIRLET7E-201ENST00000362102 79 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093392.1-201ENST00000366280 340 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGB1P39-201ENST00000366304 880 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6G6E-225ENST00000383418 383 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL5P35-201ENST00000398869 816 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011998.2-201ENST00000430884 473 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMF-203ENST00000431415 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL3P8-201ENST00000432928 1191 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069285.1-201ENST00000450891 419 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF3AP1-201ENST00000454055 611 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYB-AS1-201ENST00000455534 449 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS1-204ENST00000486171 803 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068790.1-201ENST00000536166 355 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THAP2-202ENST00000547843 672 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005726.6-201ENST00000579019 1083 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AURKC-206ENST00000598785 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCGB2B3P-201ENST00000599388 409 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004840.2-201ENST00000603368 285 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004466.3-201ENST00000615576 546 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354718.2-201ENST00000618030 371 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM74A4-202ENST00000618177 469 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6877-201ENST00000620452 64 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC048380.3-201ENST00000623145 796 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136967.1-201ENST00000625120 441 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 snoMe28S-Am2634.2-201ENST00000637869 80 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000705.2-201ENST00000433524 1386 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf73-202ENST00000507606 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4C15-201ENST00000314644 1113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPANXC-201ENST00000358993 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP37-201ENST00000364494 296 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108059.1-201ENST00000411629 725 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPGP11-201ENST00000411777 232 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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