Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 MARK3P1-201ENST00000604796 643 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC243654.1-201ENST00000620218 293 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 NXT2-204ENST00000372107 937 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC234778.1-201ENST00000399253 370 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 TUBBP9-201ENST00000405234 1099 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AP001342.1-201ENST00000423389 525 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 FKBP1AP3-201ENST00000423650 319 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL512366.1-201ENST00000438919 636 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL359711.1-201ENST00000441999 123 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL541P-201ENST00000464317 283 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 TCEA1-204ENST00000518784 586 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC087627.1-201ENST00000522339 993 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC078927.1-201ENST00000539652 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AEBP2-207ENST00000541908 975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC078886.1-201ENST00000549144 554 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC060766.6-201ENST00000589099 394 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC007136.1-201ENST00000589141 199 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 INTS6-AS1-204ENST00000593709 648 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL138689.1-201ENST00000614612 668 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC01727-202ENST00000623256 1218 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC105339.4-201ENST00000624471 737 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 FCGR3B-204ENST00000531221 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 FBXW7-204ENST00000393956 1735 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 KLRB1-201ENST00000229402 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 METTL18-202ENST00000310392 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMGB1P1B2RPK0 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms