Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 BMS1P8-201ENST00000565049 1178 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 CBLN2-203ENST00000581073 537 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AL583859.2-202ENST00000602311 505 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 OR5AU1-204ENST00000641822 1197 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 LIMA1-216ENST00000552909 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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