Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DKK3Q9UBP4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms