Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FANCFQ9NPI8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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