Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Tm4sf20Q9CQY8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Tm4sf20Q9CQY8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Tm4sf20Q9CQY8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tm4sf20Q9CQY8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tm4sf20Q9CQY8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Tm4sf20Q9CQY8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Tm4sf20Q9CQY8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Tm4sf20Q9CQY8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Tm4sf20Q9CQY8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tm4sf20Q9CQY8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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