Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC50A1Q9BRV3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC50A1Q9BRV3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC50A1Q9BRV3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms