Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms