Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POP1Q99575 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POP1Q99575 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POP1Q99575 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POP1Q99575 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms