Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD50Q92878 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD50Q92878 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms