Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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Prm3Q62100 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prm3Q62100 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms