Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPRD2Q5VT52 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPRD2Q5VT52 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms