Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEND3Q5T5X7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEND3Q5T5X7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms