Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SVEP1Q4LDE5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVEP1Q4LDE5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms