Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdgfl1Q2VPR5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms