Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS72Q15906 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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