Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL9A3Q14050 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL9A3Q14050 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
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