Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RLFQ13129 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLFQ13129 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLFQ13129 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLFQ13129 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLFQ13129 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLFQ13129 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLFQ13129 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLFQ13129 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLFQ13129 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLFQ13129 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLFQ13129 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLFQ13129 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLFQ13129 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLFQ13129 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RLFQ13129 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RLFQ13129 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLFQ13129 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLFQ13129 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RLFQ13129 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLFQ13129 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLFQ13129 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLFQ13129 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RLFQ13129 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLFQ13129 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms