Protein–RNA interactions for Protein: Q12481

RRP36, rRNA biogenesis protein RRP36, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP36Q12481 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.17□□□□□ -2.38
RRP36Q12481 YNL211CYNL211C 261 nt0.17□□□□□ -2.38
RRP36Q12481 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.17□□□□□ -2.38
RRP36Q12481 PRP42YDR235W 1635 nt0.16□□□□□ -2.38
RRP36Q12481 YLR456WYLR456W 615 nt0.15□□□□□ -2.39
RRP36Q12481 YNL303WYNL303W 348 nt0.15□□□□□ -2.39
RRP36Q12481 snR41snR41 95 nt0.15□□□□□ -2.39
RRP36Q12481 PRP5YBR237W 2550 nt0.15□□□□□ -2.39
RRP36Q12481 MRPL50YNR022C 420 nt0.14□□□□□ -2.39
RRP36Q12481 HAL9YOL089C 3093 nt0.14□□□□□ -2.39
RRP36Q12481 ASE1YOR058C 2658 nt0.13□□□□□ -2.39
RRP36Q12481 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.12□□□□□ -2.39
RRP36Q12481 TOM22YNL131W 459 nt0.12□□□□□ -2.39
RRP36Q12481 SGF11YPL047W 300 nt0.12□□□□□ -2.39
RRP36Q12481 STE5YDR103W 2754 nt0.12□□□□□ -2.39
RRP36Q12481 ORC3YLL004W 1851 nt0.11□□□□□ -2.39
RRP36Q12481 COX12YLR038C 252 nt0.1□□□□□ -2.39
RRP36Q12481 LEE1YPL054W 906 nt0.1□□□□□ -2.39
RRP36Q12481 YPL068CYPL068C 882 nt0.09□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.07□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.07□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.06□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 YDL158CYDL158C 309 nt0.06□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.06□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 YOR345CYOR345C 351 nt0.06□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 snR190snR190 190 nt0.06□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 THO2YNL139C 4794 nt0.06□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.06□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 YPL225WYPL225W 441 nt0.05□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.04□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.04□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 TAR1YLR154W-C 375 nt0.04□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 NNF2YGR089W 2811 nt0.04□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 RPS25BYLR333C 327 nt0.03□□□□□ -2.4
RRP36Q12481 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.02□□□□□ -2.41
RRP36Q12481 RPS26AYGL189C 360 nt0.01□□□□□ -2.41
RRP36Q12481 YLR334CYLR334C 381 nt0.01□□□□□ -2.41
RRP36Q12481 RCO1YMR075W 2055 nt-0.01□□□□□ -2.41
RRP36Q12481 YNL146WYNL146W 303 nt-0.02□□□□□ -2.41
RRP36Q12481 COG8YML071C 1824 nt-0.02□□□□□ -2.41
RRP36Q12481 VPS20YMR077C 666 nt-0.03□□□□□ -2.41
RRP36Q12481 YHR138CYHR138C 345 nt-0.04□□□□□ -2.42
RRP36Q12481 YPR092WYPR092W 306 nt-0.04□□□□□ -2.42
RRP36Q12481 YJL120WYJL120W 324 nt-0.06□□□□□ -2.42
RRP36Q12481 BUL2YML111W 2763 nt-0.06□□□□□ -2.42
RRP36Q12481 SSS1YDR086C 243 nt-0.07□□□□□ -2.42
RRP36Q12481 CSN9YDR179C 489 nt-0.07□□□□□ -2.42
RRP36Q12481 YAR029WYAR029W 225 nt-0.07□□□□□ -2.42
RRP36Q12481 snR45snR45 172 nt-0.07□□□□□ -2.42
RRP36Q12481 YLR434CYLR434C 384 nt-0.08□□□□□ -2.42
RRP36Q12481 snR189snR189 189 nt-0.08□□□□□ -2.42
RRP36Q12481 NIP1YMR309C 2439 nt-0.09□□□□□ -2.42
RRP36Q12481 COY1YKL179C 2040 nt-0.09□□□□□ -2.42
RRP36Q12481 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-0.1□□□□□ -2.43
RRP36Q12481 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-0.11□□□□□ -2.43
RRP36Q12481 ULI1YFR026C 510 nt-0.11□□□□□ -2.43
RRP36Q12481 YKL063CYKL063C 504 nt-0.11□□□□□ -2.43
RRP36Q12481 YKL136WYKL136W 399 nt-0.11□□□□□ -2.43
RRP36Q12481 ATP19YOL077W-A 207 nt-0.11□□□□□ -2.43
RRP36Q12481 RPL35AYDL191W 363 nt-0.12□□□□□ -2.43
RRP36Q12481 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.12□□□□□ -2.43
RRP36Q12481 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.13□□□□□ -2.43
RRP36Q12481 YLR232WYLR232W 348 nt-0.13□□□□□ -2.43
RRP36Q12481 YLR282CYLR282C 342 nt-0.13□□□□□ -2.43
RRP36Q12481 YKU70YMR284W 1809 nt-0.15□□□□□ -2.43
RRP36Q12481 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.15□□□□□ -2.43
RRP36Q12481 YCR022CYCR022C 345 nt-0.16□□□□□ -2.44
RRP36Q12481 PRM3YPL192C 402 nt-0.17□□□□□ -2.44
RRP36Q12481 YEL073CYEL073C 324 nt-0.18□□□□□ -2.44
RRP36Q12481 YLR202CYLR202C 327 nt-0.18□□□□□ -2.44
RRP36Q12481 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-0.18□□□□□ -2.44
RRP36Q12481 YJL007CYJL007C 315 nt-0.19□□□□□ -2.44
RRP36Q12481 PRP39YML046W 1890 nt-0.2□□□□□ -2.44
RRP36Q12481 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-0.21□□□□□ -2.44
RRP36Q12481 YPL205CYPL205C 345 nt-0.21□□□□□ -2.44
RRP36Q12481 SOV1YMR066W 2697 nt-0.21□□□□□ -2.44
RRP36Q12481 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.22□□□□□ -2.44
RRP36Q12481 YAR053WYAR053W 297 nt-0.22□□□□□ -2.44
RRP36Q12481 HTB2YBL002W 396 nt-0.23□□□□□ -2.45
RRP36Q12481 CSE2YNR010W 450 nt-0.23□□□□□ -2.45
RRP36Q12481 snR128snR128 126 nt-0.23□□□□□ -2.45
RRP36Q12481 YER137W-AYER137W-A 306 nt-0.24□□□□□ -2.45
RRP36Q12481 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-0.24□□□□□ -2.45
RRP36Q12481 SNU13YEL026W 381 nt-0.25□□□□□ -2.45
RRP36Q12481 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.25□□□□□ -2.45
RRP36Q12481 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.25□□□□□ -2.45
RRP36Q12481 BLI1YKL061W 342 nt-0.25□□□□□ -2.45
RRP36Q12481 snR8snR8 190 nt-0.27□□□□□ -2.45
RRP36Q12481 RPS27BYHR021C 249 nt-0.27□□□□□ -2.45
RRP36Q12481 UTP8YGR128C 2142 nt-0.28□□□□□ -2.45
RRP36Q12481 YDR048CYDR048C 315 nt-0.28□□□□□ -2.45
RRP36Q12481 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.28□□□□□ -2.45
RRP36Q12481 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.29□□□□□ -2.46
RRP36Q12481 YBR285WYBR285W 435 nt-0.29□□□□□ -2.46
RRP36Q12481 CSE1YGL238W 2883 nt-0.3□□□□□ -2.46
RRP36Q12481 YDR366CYDR366C 399 nt-0.31□□□□□ -2.46
RRP36Q12481 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.32□□□□□ -2.46
RRP36Q12481 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-0.32□□□□□ -2.46
RRP36Q12481 YDR210WYDR210W 228 nt-0.33□□□□□ -2.46
RRP36Q12481 YER079WYER079W 633 nt-0.33□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.2 ms