Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX4Q06945 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms