Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EGR4Q05215 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms