Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLTCQ00610 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTCQ00610 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms