Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARSP54136 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RARSP54136 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARSP54136 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RARSP54136 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RARSP54136 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARSP54136 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARSP54136 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARSP54136 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARSP54136 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARSP54136 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARSP54136 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARSP54136 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RARSP54136 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARSP54136 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARSP54136 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARSP54136 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARSP54136 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARSP54136 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARSP54136 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARSP54136 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARSP54136 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARSP54136 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARSP54136 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARSP54136 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARSP54136 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARSP54136 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARSP54136 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARSP54136 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARSP54136 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARSP54136 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARSP54136 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARSP54136 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARSP54136 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARSP54136 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARSP54136 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARSP54136 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARSP54136 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARSP54136 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RARSP54136 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARSP54136 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARSP54136 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARSP54136 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARSP54136 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARSP54136 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARSP54136 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARSP54136 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RARSP54136 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RARSP54136 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RARSP54136 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms