Protein–RNA interactions for Protein: P47040

YHC3, Protein BTN1, yeastyeast

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC3P47040 PAA1YDR071C 576 nt0.7□□□□□ -2.3
YHC3P47040 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.69□□□□□ -2.3
YHC3P47040 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.69□□□□□ -2.3
YHC3P47040 YDR048CYDR048C 315 nt0.68□□□□□ -2.3
YHC3P47040 TAR1YLR154W-C 375 nt0.68□□□□□ -2.3
YHC3P47040 YPL225WYPL225W 441 nt0.68□□□□□ -2.3
YHC3P47040 ASE1YOR058C 2658 nt0.67□□□□□ -2.3
YHC3P47040 YNL211CYNL211C 261 nt0.67□□□□□ -2.3
YHC3P47040 YPR012WYPR012W 255 nt0.67□□□□□ -2.3
YHC3P47040 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.67□□□□□ -2.3
YHC3P47040 IQG1YPL242C 4488 nt0.67□□□□□ -2.3
YHC3P47040 NPR2YEL062W 1848 nt0.66□□□□□ -2.3
YHC3P47040 SSS1YDR086C 243 nt0.66□□□□□ -2.3
YHC3P47040 RPL26BYGR034W 384 nt0.66□□□□□ -2.3
YHC3P47040 YMR321CYMR321C 318 nt0.66□□□□□ -2.3
YHC3P47040 SGF11YPL047W 300 nt0.65□□□□□ -2.31
YHC3P47040 CHS6YJL099W 2241 nt0.65□□□□□ -2.31
YHC3P47040 BEM3YPL115C 3387 nt0.65□□□□□ -2.31
YHC3P47040 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.64□□□□□ -2.31
YHC3P47040 YOL014WYOL014W 375 nt0.64□□□□□ -2.31
YHC3P47040 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.64□□□□□ -2.31
YHC3P47040 NHP2YDL208W 471 nt0.63□□□□□ -2.31
YHC3P47040 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.62□□□□□ -2.31
YHC3P47040 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.61□□□□□ -2.31
YHC3P47040 HAL9YOL089C 3093 nt0.6□□□□□ -2.31
YHC3P47040 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.6□□□□□ -2.31
YHC3P47040 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.6□□□□□ -2.31
YHC3P47040 YOR218CYOR218C 420 nt0.6□□□□□ -2.31
YHC3P47040 YML002WYML002W 2214 nt0.6□□□□□ -2.31
YHC3P47040 COG8YML071C 1824 nt0.59□□□□□ -2.31
YHC3P47040 YAF9YNL107W 681 nt0.59□□□□□ -2.31
YHC3P47040 SEC8YPR055W 3198 nt0.58□□□□□ -2.32
YHC3P47040 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.58□□□□□ -2.32
YHC3P47040 YPR197CYPR197C 564 nt0.58□□□□□ -2.32
YHC3P47040 YDR102CYDR102C 333 nt0.57□□□□□ -2.32
YHC3P47040 RPS27BYHR021C 249 nt0.57□□□□□ -2.32
YHC3P47040 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.57□□□□□ -2.32
YHC3P47040 FYV10YIL097W 1551 nt0.57□□□□□ -2.32
YHC3P47040 THO2YNL139C 4794 nt0.56□□□□□ -2.32
YHC3P47040 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHC3P47040 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHC3P47040 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHC3P47040 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHC3P47040 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHC3P47040 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHC3P47040 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHC3P47040 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHC3P47040 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHC3P47040 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHC3P47040 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YHC3P47040 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.56□□□□□ -2.32
YHC3P47040 UTP10YJL109C 5310 nt0.55□□□□□ -2.32
YHC3P47040 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.55□□□□□ -2.32
YHC3P47040 CSE2YNR010W 450 nt0.55□□□□□ -2.32
YHC3P47040 HTL1YCR020W-B 237 nt0.54□□□□□ -2.32
YHC3P47040 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.54□□□□□ -2.32
YHC3P47040 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.54□□□□□ -2.32
YHC3P47040 STE5YDR103W 2754 nt0.54□□□□□ -2.32
YHC3P47040 AI1Q0050 2505 nt0.53□□□□□ -2.32
YHC3P47040 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.53□□□□□ -2.32
YHC3P47040 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.53□□□□□ -2.32
YHC3P47040 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.53□□□□□ -2.32
YHC3P47040 VIK1YPL253C 1944 nt0.53□□□□□ -2.32
YHC3P47040 snR60snR60 104 nt0.52□□□□□ -2.33
YHC3P47040 COX5BYIL111W 456 nt0.52□□□□□ -2.33
YHC3P47040 snR190snR190 190 nt0.52□□□□□ -2.33
YHC3P47040 FMP27YLR454W 7887 nt0.52□□□□□ -2.33
YHC3P47040 ULP2YIL031W 3105 nt0.51□□□□□ -2.33
YHC3P47040 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.51□□□□□ -2.33
YHC3P47040 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.51□□□□□ -2.33
YHC3P47040 PRP5YBR237W 2550 nt0.51□□□□□ -2.33
YHC3P47040 YIL032CYIL032C 357 nt0.5□□□□□ -2.33
YHC3P47040 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.49□□□□□ -2.33
YHC3P47040 TRS65YGR166W 1683 nt0.49□□□□□ -2.33
YHC3P47040 MLP2YIL149C 5040 nt0.48□□□□□ -2.33
YHC3P47040 OST4YDL232W 111 nt0.48□□□□□ -2.33
YHC3P47040 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.48□□□□□ -2.33
YHC3P47040 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.48□□□□□ -2.33
YHC3P47040 snR36snR36 182 nt0.48□□□□□ -2.33
YHC3P47040 PRP42YDR235W 1635 nt0.46□□□□□ -2.34
YHC3P47040 PET111YMR257C 2403 nt0.46□□□□□ -2.34
YHC3P47040 YGL149WYGL149W 306 nt0.46□□□□□ -2.34
YHC3P47040 YKL136WYKL136W 399 nt0.46□□□□□ -2.34
YHC3P47040 MLP1YKR095W 5628 nt0.45□□□□□ -2.34
YHC3P47040 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.45□□□□□ -2.34
YHC3P47040 ATP6Q0085 780 nt0.44□□□□□ -2.34
YHC3P47040 YFL063WYFL063W 456 nt0.44□□□□□ -2.34
YHC3P47040 ESP1YGR098C 4893 nt0.43□□□□□ -2.34
YHC3P47040 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.43□□□□□ -2.34
YHC3P47040 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.43□□□□□ -2.34
YHC3P47040 YLR282CYLR282C 342 nt0.43□□□□□ -2.34
YHC3P47040 ABF2YMR072W 552 nt0.43□□□□□ -2.34
YHC3P47040 SBH1YER087C-B 249 nt0.42□□□□□ -2.34
YHC3P47040 GIM4YEL003W 336 nt0.41□□□□□ -2.34
YHC3P47040 YFL032WYFL032W 321 nt0.41□□□□□ -2.34
YHC3P47040 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.41□□□□□ -2.34
YHC3P47040 YNL028WYNL028W 318 nt0.41□□□□□ -2.34
YHC3P47040 YOR345CYOR345C 351 nt0.41□□□□□ -2.34
YHC3P47040 COY1YKL179C 2040 nt0.41□□□□□ -2.34
YHC3P47040 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.9 ms