Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stfa3P35173 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stfa3P35173 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stfa3P35173 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa3P35173 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms