Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCKSP29966 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCKSP29966 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms