Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFNA1P20827 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms