Protein–RNA interactions for Protein: P0CX84

RPL35A, 60S ribosomal protein L35-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL35AP0CX84 YKU70YMR284W 1809 nt-0.36□□□□□ -2.47
RPL35AP0CX84 NIP100YPL174C 2607 nt-0.37□□□□□ -2.47
RPL35AP0CX84 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.38□□□□□ -2.47
RPL35AP0CX84 snR46snR46 197 nt-0.38□□□□□ -2.47
RPL35AP0CX84 snR8snR8 190 nt-0.39□□□□□ -2.47
RPL35AP0CX84 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.39□□□□□ -2.47
RPL35AP0CX84 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.4□□□□□ -2.47
RPL35AP0CX84 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.41□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 HMRA2YCR096C 360 nt-0.41□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.41□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 YLR269CYLR269C 351 nt-0.41□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-0.42□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 snR128snR128 126 nt-0.42□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 RAD61YDR014W 1944 nt-0.42□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.43□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 Q0255Q0255 1419 nt-0.44□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 YNL319WYNL319W 441 nt-0.44□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.44□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 GPI15YNL038W 690 nt-0.45□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 SGF11YPL047W 300 nt-0.45□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.46□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 YKL083WYKL083W 615 nt-0.46□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 TAH1YCR060W 336 nt-0.47□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.47□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 YML007C-AYML007C-A 111 nt-0.47□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 SEC10YLR166C 2616 nt-0.47□□□□□ -2.48
RPL35AP0CX84 YEL073CYEL073C 324 nt-0.49□□□□□ -2.49
RPL35AP0CX84 SBH2YER019C-A 267 nt-0.49□□□□□ -2.49
RPL35AP0CX84 ZEO1YOL109W 342 nt-0.49□□□□□ -2.49
RPL35AP0CX84 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-0.5□□□□□ -2.49
RPL35AP0CX84 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.5□□□□□ -2.49
RPL35AP0CX84 YPL225WYPL225W 441 nt-0.5□□□□□ -2.49
RPL35AP0CX84 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.51□□□□□ -2.49
RPL35AP0CX84 FYV7YLR068W 456 nt-0.52□□□□□ -2.49
RPL35AP0CX84 YNL303WYNL303W 348 nt-0.52□□□□□ -2.49
RPL35AP0CX84 DIE2YGR227W 1578 nt-0.53□□□□□ -2.49
RPL35AP0CX84 YDR426CYDR426C 378 nt-0.55□□□□□ -2.5
RPL35AP0CX84 YHR125WYHR125W 306 nt-0.56□□□□□ -2.5
RPL35AP0CX84 YLR101CYLR101C 396 nt-0.57□□□□□ -2.5
RPL35AP0CX84 YAR047CYAR047C 321 nt-0.57□□□□□ -2.5
RPL35AP0CX84 GLG1YKR058W 1851 nt-0.58□□□□□ -2.5
RPL35AP0CX84 YCR022CYCR022C 345 nt-0.58□□□□□ -2.5
RPL35AP0CX84 HTB2YBL002W 396 nt-0.58□□□□□ -2.5
RPL35AP0CX84 PCF11YDR228C 1881 nt-0.58□□□□□ -2.5
RPL35AP0CX84 ECL1YGR146C 636 nt-0.59□□□□□ -2.5
RPL35AP0CX84 YPL068CYPL068C 882 nt-0.59□□□□□ -2.5
RPL35AP0CX84 EAF6YJR082C 342 nt-0.6□□□□□ -2.51
RPL35AP0CX84 PCC1YKR095W-A 267 nt-0.6□□□□□ -2.51
RPL35AP0CX84 RPS25BYLR333C 327 nt-0.6□□□□□ -2.51
RPL35AP0CX84 YLR334CYLR334C 381 nt-0.61□□□□□ -2.51
RPL35AP0CX84 YPR092WYPR092W 306 nt-0.61□□□□□ -2.51
RPL35AP0CX84 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-0.63□□□□□ -2.51
RPL35AP0CX84 YJL007CYJL007C 315 nt-0.63□□□□□ -2.51
RPL35AP0CX84 YLR282CYLR282C 342 nt-0.63□□□□□ -2.51
RPL35AP0CX84 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.63□□□□□ -2.51
RPL35AP0CX84 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.64□□□□□ -2.51
RPL35AP0CX84 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-0.64□□□□□ -2.51
RPL35AP0CX84 YLR456WYLR456W 615 nt-0.66□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 URB1YKL014C 5295 nt-0.66□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 YER084W-AYER084W-A 513 nt-0.67□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 YJL120WYJL120W 324 nt-0.67□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 YHR130CYHR130C 336 nt-0.68□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 AIM29YKR074W 468 nt-0.68□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 CBS1YDL069C 690 nt-0.69□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 YHR138CYHR138C 345 nt-0.69□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 YKL123WYKL123W 381 nt-0.7□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 snR54snR54 86 nt-0.7□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 YPL205CYPL205C 345 nt-0.71□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 RPM2YML091C 3609 nt-0.72□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.72□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.72□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.72□□□□□ -2.52
RPL35AP0CX84 YFL012WYFL012W 447 nt-0.73□□□□□ -2.53
RPL35AP0CX84 YBR099CYBR099C 384 nt-0.74□□□□□ -2.53
RPL35AP0CX84 SNU13YEL026W 381 nt-0.75□□□□□ -2.53
RPL35AP0CX84 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-0.77□□□□□ -2.53
RPL35AP0CX84 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.78□□□□□ -2.53
RPL35AP0CX84 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-0.79□□□□□ -2.54
RPL35AP0CX84 YDR366CYDR366C 399 nt-0.8□□□□□ -2.54
RPL35AP0CX84 BI2Q0110 1272 nt-0.8□□□□□ -2.54
RPL35AP0CX84 BLI1YKL061W 342 nt-0.8□□□□□ -2.54
RPL35AP0CX84 YLR041WYLR041W 321 nt-0.8□□□□□ -2.54
RPL35AP0CX84 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.8□□□□□ -2.54
RPL35AP0CX84 snR161snR161 161 nt-0.81□□□□□ -2.54
RPL35AP0CX84 EST1YLR233C 2100 nt-0.82□□□□□ -2.54
RPL35AP0CX84 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.82□□□□□ -2.54
RPL35AP0CX84 YER006C-AYER006C-A 318 nt-0.83□□□□□ -2.54
RPL35AP0CX84 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.84□□□□□ -2.54
RPL35AP0CX84 YAR029WYAR029W 225 nt-0.85□□□□□ -2.55
RPL35AP0CX84 snR33snR33 183 nt-0.86□□□□□ -2.55
RPL35AP0CX84 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.87□□□□□ -2.55
RPL35AP0CX84 VPS20YMR077C 666 nt-0.87□□□□□ -2.55
RPL35AP0CX84 STE18YJR086W 333 nt-0.88□□□□□ -2.55
RPL35AP0CX84 AGA2YGL032C 264 nt-0.94□□□□□ -2.56
RPL35AP0CX84 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.94□□□□□ -2.56
RPL35AP0CX84 PRM3YPL192C 402 nt-0.94□□□□□ -2.56
RPL35AP0CX84 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.96□□□□□ -2.56
RPL35AP0CX84 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.97□□□□□ -2.56
RPL35AP0CX84 YNL122CYNL122C 348 nt-0.97□□□□□ -2.56
RPL35AP0CX84 CSE2YNR010W 450 nt-0.97□□□□□ -2.56
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