Protein–RNA interactions for Protein: P0C2H7

RPL27B, 60S ribosomal protein L27-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL27BP0C2H7 ESP1YGR098C 4893 nt0.24□□□□□ -2.37
RPL27BP0C2H7 OST4YDL232W 111 nt0.23□□□□□ -2.37
RPL27BP0C2H7 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.23□□□□□ -2.37
RPL27BP0C2H7 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.23□□□□□ -2.37
RPL27BP0C2H7 PRM3YPL192C 402 nt0.23□□□□□ -2.37
RPL27BP0C2H7 Q0017Q0017 162 nt0.23□□□□□ -2.37
RPL27BP0C2H7 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.22□□□□□ -2.37
RPL27BP0C2H7 YER079WYER079W 633 nt0.22□□□□□ -2.37
RPL27BP0C2H7 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.22□□□□□ -2.37
RPL27BP0C2H7 MLP1YKR095W 5628 nt0.21□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 PRP42YDR235W 1635 nt0.21□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.21□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 YHR138CYHR138C 345 nt0.21□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 YJR157WYJR157W 363 nt0.21□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.21□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 snR190snR190 190 nt0.21□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 AGA2YGL032C 264 nt0.2□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 YNL324WYNL324W 396 nt0.2□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.19□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 YOR121CYOR121C 306 nt0.19□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 HAL9YOL089C 3093 nt0.19□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 YMR160WYMR160W 2451 nt0.19□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 YAR053WYAR053W 297 nt0.18□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 HTB2YBL002W 396 nt0.18□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 RPL35AYDL191W 363 nt0.17□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.17□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.17□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 YOR345CYOR345C 351 nt0.17□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 SSS1YDR086C 243 nt0.16□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.16□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 INA22YIR024C 651 nt0.16□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.16□□□□□ -2.38
RPL27BP0C2H7 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.15□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.14□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 ORC3YLL004W 1851 nt0.14□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.13□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.13□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 LEE1YPL054W 906 nt0.13□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 TRS65YGR166W 1683 nt0.13□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 BIR1YJR089W 2865 nt0.13□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 NNF2YGR089W 2811 nt0.12□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 UTP20YBL004W 7482 nt0.12□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 COG8YML071C 1824 nt0.11□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 YDR048CYDR048C 315 nt0.11□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 RPS26AYGL189C 360 nt0.11□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 YKL136WYKL136W 399 nt0.11□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 YPR092WYPR092W 306 nt0.11□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.11□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 ULP2YIL031W 3105 nt0.11□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.1□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.1□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 YLR282CYLR282C 342 nt0.1□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 BIL1YOR304C-A 231 nt0.1□□□□□ -2.39
RPL27BP0C2H7 ULI1YFR026C 510 nt0.09□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 YNL146WYNL146W 303 nt0.09□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.09□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 COY1YKL179C 2040 nt0.08□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 RPS27BYHR021C 249 nt0.08□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 RCO1YMR075W 2055 nt0.08□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 YCR022CYCR022C 345 nt0.07□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.07□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 CSE2YNR010W 450 nt0.06□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 NIP1YMR309C 2439 nt0.06□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 YGR035CYGR035C 351 nt0.05□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.05□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 MYO1YHR023W 5787 nt0.04□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 COX12YLR038C 252 nt0.04□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.03□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.03□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.03□□□□□ -2.4
RPL27BP0C2H7 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.02□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.02□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.02□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.02□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.01□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 BLI1YKL061W 342 nt0.01□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 YOR029WYOR029W 336 nt0.01□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 snR60snR60 104 nt0□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 YKU70YMR284W 1809 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 SNU13YEL026W 381 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 BUL2YML111W 2763 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPL27BP0C2H7 YFL063WYFL063W 456 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPL27BP0C2H7 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPL27BP0C2H7 YLR041WYLR041W 321 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPL27BP0C2H7 AI1Q0050 2505 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPL27BP0C2H7 YDR366CYDR366C 399 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPL27BP0C2H7 YEL073CYEL073C 324 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPL27BP0C2H7 YDR157WYDR157W 402 nt-0.06□□□□□ -2.42
RPL27BP0C2H7 YIL032CYIL032C 357 nt-0.06□□□□□ -2.42
RPL27BP0C2H7 HTL1YCR020W-B 237 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPL27BP0C2H7 VAR1Q0140 1197 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPL27BP0C2H7 YGR069WYGR069W 336 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPL27BP0C2H7 Q0144Q0144 330 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPL27BP0C2H7 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPL27BP0C2H7 YLR232WYLR232W 348 nt-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.5 ms