Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP6O75581 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP6O75581 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP6O75581 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP6O75581 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP6O75581 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP6O75581 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP6O75581 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP6O75581 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP6O75581 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP6O75581 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRP6O75581 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRP6O75581 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRP6O75581 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRP6O75581 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRP6O75581 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRP6O75581 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRP6O75581 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRP6O75581 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRP6O75581 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRP6O75581 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRP6O75581 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LRP6O75581 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRP6O75581 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRP6O75581 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRP6O75581 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRP6O75581 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRP6O75581 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRP6O75581 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRP6O75581 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRP6O75581 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRP6O75581 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRP6O75581 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRP6O75581 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRP6O75581 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRP6O75581 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRP6O75581 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRP6O75581 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRP6O75581 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP6O75581 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP6O75581 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP6O75581 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP6O75581 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP6O75581 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP6O75581 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP6O75581 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP6O75581 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP6O75581 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP6O75581 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP6O75581 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRP6O75581 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRP6O75581 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRP6O75581 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRP6O75581 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRP6O75581 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRP6O75581 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRP6O75581 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRP6O75581 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRP6O75581 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRP6O75581 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LRP6O75581 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRP6O75581 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRP6O75581 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRP6O75581 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LRP6O75581 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRP6O75581 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRP6O75581 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRP6O75581 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms