Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPHP4O75161 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms