Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIP1O00291 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIP1O00291 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIP1O00291 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIP1O00291 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIP1O00291 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIP1O00291 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIP1O00291 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIP1O00291 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIP1O00291 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIP1O00291 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIP1O00291 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIP1O00291 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIP1O00291 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIP1O00291 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIP1O00291 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIP1O00291 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIP1O00291 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIP1O00291 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIP1O00291 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIP1O00291 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms