Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC85CA6NKD9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms