Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC005841.2-201ENST00000637658 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC02026-201ENST00000397645 1615 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC087501.5-201ENST00000607496 2374 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 EEF1A1P11-201ENST00000415278 1389 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ZNF878-201ENST00000547628 1734 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TMEM52B-203ENST00000381923 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 KDELC1P1-201ENST00000512118 1509 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TOM1L1-203ENST00000536554 1522 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 OR8G3P-203ENST00000641848 1344 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GLRA3-202ENST00000340217 3065 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PIBF1-208ENST00000617689 2882 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC068512.1-201ENST00000584542 1811 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GSTM1-203ENST00000369819 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RPSAP42-201ENST00000403415 878 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL023755.1-203ENST00000422253 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC011747.1-201ENST00000425678 565 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 OR5M13P-201ENST00000433944 937 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC01852-201ENST00000434223 967 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GAGE12J-201ENST00000442437 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL157714.2-204ENST00000452283 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 NPSR1-208ENST00000465305 814 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RN7SL621P-201ENST00000472565 299 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RN7SL333P-201ENST00000476398 297 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC093010.2-201ENST00000481773 743 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC009269.1-202ENST00000484381 469 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC117392.1-201ENST00000487061 596 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 IGHVII-22-1-201ENST00000517888 265 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CHCHD7-205ENST00000517933 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC01288-201ENST00000519189 529 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC087269.1-201ENST00000522213 666 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CHCHD7-215ENST00000523061 557 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AP000879.2-201ENST00000530525 497 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 EIF4A1P4-201ENST00000550578 1213 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC024270.1-201ENST00000559181 404 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SOD1P2-201ENST00000563903 451 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GLUD1P8-201ENST00000585063 203 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC01483-205ENST00000591334 620 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL356052.1-201ENST00000605764 376 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC026367.2-201ENST00000610630 553 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.39-201ENST00000614194 271 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC099811.5-201ENST00000617211 819 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AP000356.4-201ENST00000639500 172 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 EPB41L5-202ENST00000331393 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 KLRC1-203ENST00000408006 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CDC25C-203ENST00000415130 1556 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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