Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC090826.1-201ENST00000564109 915 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 RN7SL237P-201ENST00000580912 287 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AL590560.2-201ENST00000608430 732 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC016394.1-201ENST00000608444 833 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 LINC01482-201ENST00000585484 2616 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CLK1-215ENST00000621181 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 HBS1L-202ENST00000367820 638 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 COQ3-202ENST00000369240 646 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 PHACTR1-204ENST00000379348 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AL109918.1-202ENST00000406724 436 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CLEC1A-203ENST00000420265 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 KRT18P53-201ENST00000431919 117 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 LINC02010-201ENST00000470860 516 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC022639.1-201ENST00000523191 573 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 LINC02443-201ENST00000536518 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 LINC02385-201ENST00000547554 428 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC239600.2-201ENST00000619615 1165 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CCL4L2-216ENST00000620098 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 NT5C2-201ENST00000343289 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CPB1-201ENST00000282957 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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PDK4Q16654 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 SLC9B1P3-201ENST00000452667 1334 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AMELY-201ENST00000215479 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CST13P-201ENST00000376992 428 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 PCBP1-AS1-212ENST00000418308 863 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AKR1B15-201ENST00000423958 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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