Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
U3KQE9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
U3KQE9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
U3KQE9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms