Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GIT1Q9Y2X7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIT1Q9Y2X7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms