Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1aQ9JLR9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms