Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pgpep1Q9ESW8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms