Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms