Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRCC1Q9C099 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms