Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM42Q9BTD8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM42Q9BTD8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms