Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC77Q9BR77 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms