Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MFSD3Q96ES6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD3Q96ES6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD3Q96ES6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD3Q96ES6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD3Q96ES6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD3Q96ES6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD3Q96ES6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD3Q96ES6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD3Q96ES6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD3Q96ES6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms