Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO3Q8TAP4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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